该数据库由GenPept（由GenBank 编码序列自动翻译而成数据库）、PDB序列数据库、SWISS-PROT数据库、SPupdate（每周更新的SWISS-PROT数据库）、PIR和GenPeptUpdate(每天更新的GenPept)数据库复合而成。因此该数据库是一个较完全的，包含最新信息的数据库。该数据库中已将那些与某一序列完全相同的序列信息剔除, 因此不包含重复信息。但严格地说，尽管NRDB数据库被称作非冗余数据库，其仍包含冗余信息。此外，由于该数据库是通过简单的比较方法生成的，因此会带来一些问题，例如，一次数据库中的错误序列被引入该数据库。